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藥物 ADME 的 “優(yōu)化利器”,解析高 Fsp³ 橋聯(lián)雙環(huán)新用途 | 樂研試劑

來源:上海皓鴻生物醫(yī)藥科技有限公司    2025年10月30日 14:52  

富含sp3雜化的橋聯(lián)雙環(huán)烷烴系統(tǒng)作為苯環(huán)的三維飽和生物電子等排體,近年來在藥物設計中備受推崇。然而,針對不同環(huán)尺寸的橋聯(lián)雙環(huán)系統(tǒng)與苯環(huán)相比的代謝穩(wěn)定性及生物轉(zhuǎn)化系統(tǒng)分析仍屬空白。近日,百時美施貴寶團隊在JMC系統(tǒng)性驗證了苯環(huán)的多種Fsp3生物電子等排體(BCP、BCHex、BCHep和BCO)相較于苯環(huán)具有更好的代謝穩(wěn)定性與ADME(吸收、分布、代謝和排泄)特性。

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Section.01

How?

苯環(huán)替換為橋聯(lián)雙環(huán)后

如何影響代謝性質(zhì)和理化性質(zhì)

 

代謝研究結(jié)果表明:(1)橋聯(lián)雙環(huán)烷類似物(3a–3f)均表現(xiàn)出優(yōu)于苯環(huán)化合物2c的代謝穩(wěn)定性。在小鼠肝微粒體(MLM)中半衰期提升5.0–7.5倍,在人肝微粒體(HLM)中提升3.9–13.7倍。 (2)立方烷類似物3g代謝穩(wěn)定性分別較化合物2c提高了3.6倍和4.5倍,但其穩(wěn)定性仍低于大多數(shù)雙環(huán)類似物,表明在該系列中橋聯(lián)雙環(huán)系統(tǒng)通常能賦予更優(yōu)的代謝穩(wěn)定性。

細胞膜滲透性實驗顯示:BCP(3a)和BCHex(3b)類似物的滲透性(164–202 nm/s)顯著高于苯環(huán)衍生物2c(115 nm/s)。水溶性測定結(jié)果顯示:在雙環(huán)類似物中,3a(BCP)的水溶性(36 μg/mL)較苯環(huán)類似物2c(6 μg/mL)提升6倍。

 

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Section.02

Why?

三維sp3富集環(huán)系增強代謝穩(wěn)定性原因

用sp3雜化的環(huán)烷基結(jié)構(gòu)單元取代單取代苯環(huán),能有效減少反應性代謝物的生成。這歸因于sp3 C-H鍵的氧化代謝通常生成無反應活性的醇類代謝物。這種更安全的代謝特征推動了人們對橋聯(lián)雙環(huán)系統(tǒng)作為環(huán)烷基拓展替代物的興趣。

 

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CYP450酶通過“氧反彈”機制介導烷基結(jié)構(gòu)氧化代謝生成羥基代謝物的過程

 

Section.03

進階版!

橋頭碳氟取代或橋鏈中
嵌入氧原子提高代謝穩(wěn)定性

 

在確定雙環(huán)結(jié)構(gòu)為代謝軟位點后,作者研究了在橋頭碳引入取代基以阻礙代謝、提高穩(wěn)定性的策略。發(fā)現(xiàn):氟代BCP衍生物4a在MLM和HLM中的代謝穩(wěn)定性分別較2c提升130倍和40倍,其半衰期超過120 min。相較于未取代BCP類似物3a,化合物4a在MLM和HLM中的代謝穩(wěn)定性分別提高24倍和7倍。

在橋頭碳引入了一系列取代基,包括鹵素、吸電子基團、給電子基團以及極性氫鍵供體,橋頭取代的BCP類似物能有效模擬對位取代的苯環(huán)類似物,從而將生物電子等排藥物設計理念的適用范圍拓展至雙取代苯體系。

為深入探究橋頭取代對代謝穩(wěn)定性的影響,作者還將研究拓展至BCHex(5a)、BCHep(5b)和BCO(5h)的氟代類似物。與氟代BCP(4a)一致:所有氟代類似物均較其未取代對應物展現(xiàn)出顯著增強的代謝穩(wěn)定性(MLM中4-18倍;HLM中3-10倍)。

 

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苯環(huán)改造策略進階版1——氟代橋聯(lián)雙環(huán)結(jié)構(gòu)

 

除了在橋頭引入氟取代基外,在橋連碳原子中引入雜原子(特別是氧)為增強橋聯(lián)雙環(huán)系統(tǒng)代謝穩(wěn)定性開辟了另一種新途徑。研究發(fā)現(xiàn):氧雜雙環(huán)類似物表現(xiàn)出顯著改善的代謝穩(wěn)定性:其MLM半衰期為65.2至>120 min,遠長于其碳環(huán)前體和2c(分別僅為4.35–6.51 min和0.87 min);HLM半衰期均超過120 min,表明氧原子的引入通過破壞細胞色素P450易攻擊的軟位點,有效減弱了氧化代謝。這凸顯了氧取代賦予的卓-越代謝抗性。MDCK滲透性實驗也揭示了氧雜雙環(huán)類似物的膜滲透性均高于苯環(huán)類似物2c,其中6b–6d的滲透性約為2c的3倍。

 

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苯環(huán)改造策略進階版2——氧雜橋聯(lián)雙環(huán)結(jié)構(gòu)

 

 

參考文獻

Surendran S, Raju S, Kalyani N, et al. Beyond Bioisosteres: Impact of Replacing a Benzene Ring with sp3-Rich Three-Dimensional Saturated Bridged Bicyclic Match Pairs on Biotransformation, Metabolic Stability, and Other ADME Profiles[J].J.Med.Chem.2025.DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01879.

 

 

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